Xenium In Situデータセット

マウス脳神経生物学の探索

248個の遺伝子で構成される事前設計済みのXenium Mouse Brain Gene Expressionパネルを用いて0.66 cm2の新鮮凍結マウス脳冠状切片から得られたXenium In Situデータセットを調べてみてください。*

Xenium Explorer デモ
Xenium Explorerの使い方
Xenium

高い感度、特異性、再現性を有する細胞内空間的遺伝子発現マップを適切な規模で構築

Xeniumはサンプル間で高い再現性を示すことを実証

隣接する新鮮凍結マウス脳切片を同じスライドに乗せて取得したin situ遺伝子発現データは、繰り返し間の技術的変動が小さいことを示しています。

出力の表示またはダウンロード

1回目

  • 細胞あたりの転写産物数の中央値
    252
  • 検出された遺伝子数
    162,033
  • 解読された転写産物の100 µm2あたりの数
    107.0
  • 検出された転写産物の総数
    49,587,802
  • 組織スキャン面積
    0.63cm²

2回目

  • 細胞あたりの転写産物数の中央値
    250
  • 検出された遺伝子数
    154,654
  • 解読された転写産物の100 µm2あたりの数
    102.1
  • 検出された転写産物の総数
    47,093,471
  • 組織スキャン面積
    0.64cm²

3回目

  • 細胞あたりの転写産物数の中央値
    253
  • 検出された遺伝子数
    158,047
  • 解読された転写産物の100 µm2あたりの数
    105.6
  • 検出された転写産物の総数
    48,460,389
  • 組織スキャン面積
    0.61cm²
*Xenium Explorer Demoで得られたデータセットの出力を表示またはダウンロードするには、*こちらをクリックしてください この小データセットは、冠状切片全体から切り取ったサブセットであり、データ解析のチュートリアルおよびビネットを容易に作成できるようにファイルサイズを小さくしています。データ品質の詳細を見るために、上の3つのデータセットで冠状切片全体をレビューすることをお勧めします。

他のXeniumデータセットの探索

ヒト乳がん
280個の遺伝子で構成されるXenium Human Breast Gene Expression Panelに33個の遺伝子を追加したパネルを使用して0.4 cm2のヒト乳がんFFPE切片から得られたXenium In Situデータセットの探索を行うために、Xenium Explorer Demoを使用できます。
ヒト乳がんデモについて
Xenium In Situ
  • 高解像度in situ遺伝子発現マッピング
  • 専門的なキュレーションがなされたカスタマイズ可能なコンテンツ
  • 使いやすいハイスループットアナライザー
  • 直感的な視覚化ソフトウェア
プラットフォームについて